Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC66A2RUB6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms