Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1W2PQD8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1W2PQD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms