Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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