Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms