Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms