Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms