Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms