Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARP1Q9Y4F1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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