Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP3Q9Y3E7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP3Q9Y3E7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms