Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG6Q9Y2V7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms