Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1DQ9Y2S0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms