Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SBNO2Q9Y2G9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms