Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
FARSAQ9Y285 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FARSAQ9Y285 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms