Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDCQ9Y266 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms