Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNEQ9Y223 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms