Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHOC2Q9UQ13 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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