Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms