Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms