Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI3Q9ULW8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms