Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV5

HSF4, Heat shock factor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF4Q9ULV5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF4Q9ULV5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF4Q9ULV5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms