Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms