Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED23Q9ULK4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED23Q9ULK4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms