Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CROTQ9UKG9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms