Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCP2D1Q9UJQ7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms