Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms