Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT172Q9UG01 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms