Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KB2Q9UBS0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPS6KB2Q9UBS0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms