Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DKK3Q9UBP4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms