Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms