Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HCN3Q9P1Z3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HCN3Q9P1Z3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms