Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLGN3Q9NZ94 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms