Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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RRN3Q9NYV6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRN3Q9NYV6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
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