Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A2Q9NTI2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms