Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms