Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOMER3Q9NSC5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms