Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL1Q9NSC2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms