Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL28Q9NRJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCL28Q9NRJ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms