Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF3Q9NR23 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF3Q9NR23 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms