Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD163L1Q9NR16 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms