Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PFDN4Q9NQP4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms