Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYLDQ9NQC7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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