Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ASCL3Q9NQ33 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms