Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms