Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IL1RAPQ9NPH3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IL1RAPQ9NPH3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms