Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms