Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD248Q9HCU0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms