Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLXNA4Q9HCM2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNA4Q9HCM2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms