Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNRC6CQ9HCJ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNRC6CQ9HCJ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms