Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPJQ9HC77 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPJQ9HC77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms