Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVMER34-1Q9H9K5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVMER34-1Q9H9K5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms